每一位登船的旅客都要接受體溫檢測。
受疫情防控影響，除香港機場航線，深圳蛇口開往珠海、澳門等地的航班都進行了大幅度調整。目前，由深圳蛇口前往香港機場航線較平日縮減2個單次航班，維持在12個單次航班/天，深圳蛇口至珠海、深圳機場碼頭至珠海、中山航線均縮減至每天1班往返，深圳蛇口至澳門航線則受澳門入境政策影響處於停航狀態。此外，根據相關防控要求，客船上座率維持在50%，旅客乘船需隔位而坐。記者從深圳航運集團了解到，海上航線運力恢復需視疫情結束而定，不過深圳航運集團將隨時根據客票情況，按實際調整航班，確保旅客出行需求。
深圳航運集團溫馨提醒廣大旅客，出行前請詳細了解碼頭相關出行信息和防控要求，乘船前需配合碼頭及客船防控檢疫工作，進行體溫監測和登記，並佩戴好口罩；前往香港機場出境的旅客需提前了解香港入境處相關要求和限制，避免遭勸返，耽誤行程。購票方面，目前提倡線上購票，大家可關注公眾號「鵬星會」查詢航班信息和購票。
客艙進行嚴格消毒。
自疫情爆發以來，深圳航運集團鵬星船務迅速行動，全面加強在崗船員安全責任意識和疫情防控認識，並制訂嚴格的船舶消毒程序和防範措施，確保出行市民生命安全、身體健康不受影響。同時，深圳航運集團啟動公共衛生安全防控機制，全面落實相關防疫舉措，築牢疫情海上防線，有力保障旅客出行需求。
客船開航前，必須進行各區域，特別是客艙、衛生間的清潔和消毒。每一艘客船在營運期間由船長負責，需要定時、定人專項負責客艙的清潔衛生，做到清掃、消毒不留死角，尤其對座椅、扶手、門把手、舷窗等旅客常接觸位置進行重點消毒；船舶過站期間，時刻保持客艙通風，並對空調系統進行清潔消毒；同時鵬星客船專門將船上VIP室改為隔離室，以備發現疑似病例進行及時有效隔離。
疫情期間，船員們嚴格執行管控要求。開航前，每一位船員都必須測試體溫，進行自身清潔消毒，做好防護；客船營運期間，旅客上船前，需配合船員的體溫檢測；此外，船員還是疫情宣傳員和監督員，在發現未佩戴口罩的旅客時，需按疫情防控特殊時期管理規定，提醒旅客佩戴，如有不聽勸阻的，報公安機關處理，在最大程度上保護船上其他旅客生命安全；同時，船員將加大客艙巡視力度，第一時間處理好旅客遺留垃圾、嘔吐物等，做好消毒防疫工作；對於可能經由香港出境但遭勸返的旅客，乘務組會及時進行心理安撫和疏導。
扶手也列入消毒範圍。
