運輸署表示，關注有過境旅客需長時間輪候跨境，會就事件與相關部門及各服務營辦商檢視並跟進。
大批內地遊客在本港參與跨年倒數活動後回內地，導致凌晨部分跨境直通巴士站有數百人等候。
運輸署發言人說，由於預計會有不少旅客在凌晨除夕煙花音樂匯演結束後乘車返回內地，服務營辦商早已根據署方建議，增加車輛數目，例如安排將太子線的服務由每15分鐘一班增至每10分鐘一班，以處理過境旅客通宵返回內地的需求。
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截至除夕(12月31日)晚上，訪港旅客數字約22萬多人次，創2023年的單日最高。旅發局繼2018年除夕後，再於2023年除夕夜復辦的「香港跨年倒數」維港煙花音樂匯演亦大受歡迎，維港兩岸超過47.9萬人觀看。
發言人提到，署方一直密切留意凌晨後各區的交通情況，並與本地及跨境交通服務營辦商保持聯繫，盡快疏導本地市民及跨境旅客，但由於凌晨後港深之間只有皇崗口岸維持客檢服務，出境旅客較預期多，皇崗口岸車流一度伸延至新田公路，因此跨境巴士營辦商即使已加派車輛，仍出現旅客需要較長時間在市區輪候跨境巴士的情況。
另外，全國人大常委李慧琼表示，今次事件是政府的配套抑或企業的應變及準備不足，還是屬於突發事故，暫時未掌握所有資料，但值得檢視各方面配套。
她又説，已經在人大常委會會議期間向海關總署提出建議，未來亦會在人大的提案中，包括便利通關和加強24小時通關的建議。
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