政府就新冠疫苗嚴重異常事件設立10億元保障基金，關注病人權益的團體認為，保障基金未有處理受影響人士的收入損失，又指申請時限只有2年是太短。
保障基金條款列明，申請人要符合兩個基本條件，包括要就涉及的嚴重異常事件得到註冊醫生證明；另外，政府成立的專家委員會未能排除事件與新冠疫苗無關。事件的嚴重程度會分四個等級，包括痛楚、長期身體損害、傷殘及死亡。
社區組織協會幹事彭鴻昌認為，安排大致合理，但一些受相對輕微事故影響的人獲得保障額不多，治療期間，可能要請病假，甚至失去工作，現時安排未有照顧工作收入損失，擔心日後向藥廠或政府追討亦不容易，期望當局考慮向證明有收入損失的人追加保障額。
基金條款亦提及，申請人要在接種最後一劑疫苗起計2年內提出申請，彭鴻昌認為，外國疫苗保障基金的申請時限可達6年，認為2年時限是太短。對於基金管理人同時負責處理申請及投訴，他認為，覆檢個案交由另一機構處理會較符合程序公義。
