6月18日，廣東東莞通報新增1例新冠肺炎確診病例李某某，與同日深圳新增的其中一例確診病例蕭某，系夫妻關係。
6月20日，東莞市麻涌鎮報告1例新冠肺炎本土確診病例，系東莞市6月18日確診病例李某某的密切接觸者。
該病例賈某某，為19歲男生，就讀於廣州新華學院東莞校區（地處麻涌鎮），為該校住校學生。6月19日凌晨，賈某某被甄別為6月18日確診病例李某某的密切接觸者。
隨後，市、鎮兩級疫情防控指揮部立即啟動應急處置機制，對其實施管控措施，對該校實行封控管理。6月20日，賈某某核酸採樣結果經複檢呈陽性，即轉定點收治醫院隔離治療，經專家會診，判定為新冠肺炎確診病例（普通型）。
目前，該病例流行病學調查、密切接觸者追蹤管理等工作正有序推進，相關居住場所和活動場所均已進行終末消毒。廣州新華學院東莞校區已實行封閉管理。
經初步甄別，確診病例涉及東莞市轄區內以下重點場所：
6月5日至11日，在校門口創客坊美食街吃飯，去華陽湖公園散步。
6月12日晚，到麻涌「DHair」理髮、麻涌星河城商場“麥當勞餐廳”用餐。
6月14日晚，到麻涌星河城商場KKV超市、屈臣氏、創客坊「一點點」購物，後去華陽湖公園散步。
6月15日晚，到創客坊「易站便利店」購物並前往古梅路“蘭州牛肉拉麵”吃飯，後去華陽湖公園散步。
6月16日晚，去華陽湖公園散步。
6月17日，晚飯後分別前往麻涌鎮星河城商場嘉榮超市和名創優品購物。
6月5日至6月18日，除到達上述地點外，其餘時間均在校內活動。
6月19日凌晨，作為確診病例李某某的密切接觸者被送至校內學術交流中心隔離觀察，後閉環轉運至定點收治醫院進行隔離治療。
新華學院東莞校區只進不出
近2萬師生不得離校
6月20日晚，東莞新增的新冠肺炎本土確診病例賈某某是廣州新華學院東莞校區的學生，目前，新華學院只進不出，停止一切線下教學，統一提供線上教學。在校學生全部回到宿舍，禁止學生之間串門聚集，校外的學生就地居家隔離。
廣州新華學院東莞校區目前在校師生有近2萬人，政府部門已派出工作組駐校，設現場指揮部，加強物資供應管理，成立物資供應小組，及時掌握師生基本生活需求，負責物資質量保障和價格監測工作。新華學院內部設有6個飯堂、1個大型物資分配中心，所需物資由嘉榮、京東等重點物資供應商進行供給，保障師生基本生活服務需求。
同時，政府部門和學校積極做好人文關懷工作。重視學生心理疏導，統計好學生中的重點人群，尤其是身體、心理健康存在特殊情況的高危人群，確保學生能平安度過。
東莞麻涌全鎮只進不出
連夜開展大規模核酸篩查
即日起，整個麻涌鎮定為封控區，全鎮各出入口設施圍閉，實行只進不出。6月20日晚6點開始，麻涌已開展第三輪全員核酸檢測。
東莞麻涌這一確診病例是6月18日東莞南城確診病例李某某的密切接觸者。6月18日起，麻涌已將信鴻嘉譽小區、麻四村、星河城市廣場、新華學院作為封閉管理區，所有住戶居家隔離。
6月18日凌晨至6月19日上午，麻涌已在全鎮範圍內開展了第二輪全員核酸檢測。共設置97個採樣點，投入380名醫護人員，共採集232455人次。目前，麻涌正加緊排查密切接觸者和次密切接觸者，摸清人員底數。
隨著麻涌全鎮封控，麻涌區域內廣大市民原則上不能離開封控區域範圍，非必要不外出、不聚集。
下一步，東莞將對已納入中風險地區的繼續嚴格落實管控；根據莞城、東城、南城、萬江、麻涌疫情實際情況，及時將有關區域納入管控範圍，並按要求採取封閉、封控、管控等三層防疫措施。
同時，為切實保障封控區域廣大市民的日常生活保障，東莞市公安部門將保證物資保障車輛的出入，憑48小時內核酸檢測陰性的二維碼方可出入。
東莞本輪首例確診感染來源查明
6月20日晚，東莞新聞發佈會通報稱：6月18日確診的、家住百悅尚城小區的李某某的陽性標本，經省疾控中心樣本二代基因測序結果顯示：樣本的覆蓋度為99.99%，屬於Delta株。李某某是輸入關聯的本地病例。
東莞市疾控中心副主任羅東表示，李某某的基因組序列與其丈夫蕭某的基因組序列高度一致。但李某某的基因組序列與本次廣州疫情的基因組序列不在同一分支。
「李某某的基因組序列與本次廣州疫情的基因組序列雖均屬於Delta株，但與廣州疫情基因組序列存在較大的差異，未發現廣州本次疫情中後期所共有的變異位點，提示分別來自不同的傳染來源。」羅東說。
羅東同時透露，東莞6月20日報告的一例確診病例賈某為密切接觸者甄別發現，賈某與李某某及蕭某是否曾於同一時段在同一場所內活動，相關情況正在進一步調查核實中。
截至20日17時，初步判定賈某在東莞市密切接觸者86人，次密切接觸者5人，已全部實施集中隔離醫學觀察。6月19日晚，對賈某就讀學校再次進行全員核酸檢測，結果全部陰性。
Delta變異株多國流行
北京日報（ID：Beijing_Daily）注意到，儘管東莞李某的基因組序列與本次廣州疫情的基因組序列不在同一分支，但皆與印度發現的Delta變異株不無關係。
6月11日，中國疾控中心研究員馮子健指出，此次廣州疫情是由在印度肆虐的Delta變異株引起。現有研究數據顯示，這個變異毒株傳播能力是目前已經確定的新冠病毒變異株中傳播能力最強的，比過去老的毒株傳播能力提高了100%，比最早在英國流行的變異株Alpha株傳播能力提高了40%以上。
6月19日晚，深圳市衛健委副主任常巨平通報，經新冠病毒基因測序，新增病例攜帶的病毒與CA868國際航班輸入的陽性病例和6月14日報告的確診病例姜某高度同源，均為Delta變異毒株。
截至6月19日，CA868國際航班報告陽性病例38例，其中確診的患者30人，這裏面包括了7例無癥狀感染者轉為確診病例，和無癥狀感染者8人。
值得警惕的是，最早在印度發現的Delta變異毒株，已悄然侵入不少國家。除了中國，在美國、英國、加拿大、德國、俄羅斯等國家，皆出現了Delta毒株的傳播。
世衛組織首席科學家蘇米婭·斯瓦米內森表示，在印度發現的Delta變異株因為傳播能力顯著增強，正在成為全球主要流行的新冠病毒變異株。
