9月20日0—24時，31個省(自治區、直轄市)和新疆生產建設兵團報告新增確診病例72例。其中境外輸入病例30例(雲南12例，上海6例，江蘇3例，廣東3例，黑龍江2例，浙江2例，福建2例)，含4例由無癥狀感染者轉為確診病例(浙江2例，福建1例，廣東1例)；本土病例42例(均在福建，其中廈門市36例、莆田市5例、泉州市1例)。 無新增死亡病例。新增疑似病例2例，均為境外輸入病例(均在上海)。
9月10日以來福建累計報告本土確診405例
9月20日0～24時，福建省報告新增本土確診病例42例(廈門市36例、泉州市1例、莆田市5例)；報告新增本土無癥狀感染者0例(註：以上均按現住址統計)。
自9月10日以來，福建省累計報告本土確診病例405例，目前住院405例，無死亡病例；現有本土無癥狀感染者尚在接受集中隔離醫學觀察3例。
目前密切接觸者已解除醫學觀察29339人，尚有7225人正在接受醫學觀察。
今起福建健康碼分為紅黃綠三類
21日起，福建健康碼狀態按風險從高到低依次細分為「紅碼」「黃碼」「綠碼」。
按照分級管理標準和具體防控措施，省數字辦會同衛健等相關部門，對福建健康碼做了進一步優化。新分類的健康碼中，綠碼錶示「未見異常」 ，體溫正常並做好個人防護，可自由有序流動、正常通行。
健康碼黃碼人員要落實核酸檢測、健康監測等措施，並做好個人防護，盡量減少流動，自覺暫停聚餐、參會等集體活動。 不得進入酒店、商場、超市、車站、機場、電影院、KTV、酒吧等各類公共場所，以及學校、各類監所、養老院和福利院等特殊場所。如發現身體不適，應做好個人防護，避免搭乘公共交通工具，立即前往就近的發熱門診進行核酸排查，並主動報告流行病學史。
健康碼紅碼人員要採取定點醫療機構隔離治療或集中、居家隔離醫學觀察， 由各級管理部門進行重點嚴格跟蹤管理，並採取一切必要的隔離、治療、核酸檢測、健康監測等措施。
當持有健康碼綠碼的群眾，在確診病例和無癥狀感染者停留過的重點場所附近區域活動並停留過，與確診病例和無癥狀感染者可能存在接觸，或者近期存在發燒、發熱等癥狀並在醫療機構就診過時，其健康碼就納入了黃碼的範圍。當健康碼變成黃碼後，持碼者在排除與確診病例和無癥狀感染者可能存在接觸的風險時段之後，憑監測期間核酸檢測陰性等相關證明，其健康碼將自動轉為綠碼。
全國高中風險區3+26個
福建省廈門市應對新冠肺炎疫情工作指揮部9月21日發佈通告：經專家研判，自2021年9月21日起，將以下區域列為中風險地區：海滄區嵩嶼街道水雲灣小區。
目前，全國共有高中風險區3+26個，均在福建省。
