2月3日時，廣東省新增本土確診病例5例，深圳4例（其中1例為無症狀感染者轉確診），惠州1例；以上均在重點人群篩查或納入管控的密切接觸者排查中發現。
就在不久之前，深圳還在慶祝擊退一波疫情。
1月29日，深圳順利「摘星」（行程碼上不再帶星號），疫情「警報」暫時解除。1月30日晚，深圳衛健委公眾號還在發文《感染了1個人，就被幹掉了！奧密克戎在深圳遭遇了什麼？》，慶祝深圳在德爾塔毒株和奧密克戎毒株的雙重夾擊下，成功擊退疫情。
僅過一日，除夕夜當晚（1月31日），深圳公佈又發現1例住在東莞、工作在深圳的新冠肺炎本土確診病例。次日(2月1日)，深圳、廣東省其他4地均有新增病例報告，總計新增10例。
值得注意的是，此10人均在對深圳報告首例確診患者的密接排查中發現。恰逢春節返鄉、拜親期間，疫情在蔓延中。
據悉，1月31日深圳報告的第1例本土新增病例，是一位45歲女子，她覺得不舒服，1月30日晚在發熱門診就診時，經核酸檢測後發現。她在深圳市寶安區石岩街道某公司做牙模設計員，但居住在東莞市鳳崗鎮保利百合花園，主要以自駕車方式上下班。
之後，深圳迅速對該病例14天內的活動軌跡、人員接觸情況進行了全面溯源，管控追蹤到的密接者、次密接者，並針對涉及市外的密接者、次密接者發出協查函。
流行病學調查追踪的效果很快顯現。次日（2月1日），深圳發現3例新增，臨近的惠州市新增1例，梅州市新增1例，雲浮市羅定市新增4例，河源市紫金縣新增1例，共計新增10例。
深圳疫情已外溢4地，紅框為出現病例地區。
這10例病例均為第1例確診的密切接觸者或重點人群，傳播鏈較為清晰。比如，深圳2月1日新增的3例中，2例在寶安區石岩街道某公司工作，1例居住在寶安區石岩街道雲熙谷二期，與第1例的工作地點存在重合。
再如，在雲浮市羅定市新增的4例病例中，病例1系深圳第1例所在公司同樓棟工作人員，病例2、3、4則是病例1的丈夫、小兒子、大兒子，為其共同生活家庭成員。
2月1日22時，深圳衛健委報道稱，深圳市疾控中心已完成第1例病例的新冠病毒全基因組測序，測序結果為奧密克戎變異株。
經國家疾控中心和廣東省疾控中心比對，該病例與國內此前發現的多起本土奧密克戎疫情病例均不同源，與近期深圳境外輸入病例感染的病毒序列也不同源。因此初步判定，這次「0131」疫情為一起新的獨立疫情。
但測序結果與全球數據庫中北美上傳的一些基因組序列100%同源。所以，本輪疫情的源頭暫不明確，需要根據流行病學調查和基因測序結果作進一步研判。
同日（2月1日），廣東省召開了全省疫情防控工作電視電話會議，指出要科學精准、快速果斷處置這次本土疫情，防止進一步擴散蔓延，盡快消除社會面傳播風險，切斷疫情傳播鏈條；結合疫情新特點，優化完善「外防輸入」防控措施，堅持人、物、環境同防。
病毒學專家常榮山認為，深圳第1例病例在除夕夜當晚才被發現感染新冠，鑒於奧密克戎的高傳播力、輕症狀和春節返鄉的背景，可判斷此輪疫情在春節之前就已外溢，「不能掉以輕心」。
據悉，自1月31日起，深圳市寶安區將石岩街道羅租社區艾美特科技園B棟調整為中風險地區。自2月1日起，深圳市龍崗區在阪田街道划定封控區、管控區和防範區。
夜晚還在工作的深圳防疫人員。
與此同時，各地的進出政策也在縮緊。自2月1日24時起，離開深圳須持有48小時內核酸檢測陰性證明。2月2日早上，雲浮市羅定市也宣佈，離開羅定須持48小時內核酸檢測陰性證明。
根據惠州市發佈的疫情管控措施通告（第22號），自2月1日24時起，所有從機場、鐵路（含城軌）、汽車客運站場離惠的旅客，須持有48小時內核酸檢測陰性證明方可出行，同時暫停惠州前往北京的航班、火車票，已售機票、火車票按規定辦理退票。
深圳在全力追查撲滅疫情，初步看來疫情未有快速擴散。
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