寒冷天氣下，細菌病毒更易入侵人體，多漱口、勤洗手是預防疾病的基本方法，當中用綠茶漱口又有很多好處。在日本靜岡縣島田市內，部份中小學引入了茶機，讓孩子們在休息時間能用綠茶漱口或喝水，學生冬天患流感疾病的人數亦大為減少。
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綠茶漱口能抗菌
綠茶裡的含有抗菌效果出色的「兒茶素」和能提升免疫力的茶氨酸。用綠茶漱口，附著在喉嚨上的細菌就會被這2種成分清潔掉。另外引致流感的病毒在濕度高的地方容易被清除，所以即使不小心喝了漱完口的綠茶也可以放心。
綠茶漱口除口臭
綠茶中有著衣物清潔噴霧劑中的「多酚」成分和香口膠中的「黃酮類化合物」，這兩種成分都有消臭作用。使用綠茶漱口，可以讓這兩種成分幫助清除口腔異味，令口氣變得清新。如果吃了氣味強烈的食材（如大蒜、蔥），不妨用綠茶漱口除口臭。
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綠茶漱口防蛀牙
綠茶內所包含的兒茶素，可以抑制造成蛀牙的轉糖鏈球菌，也包含預防蛀牙的氟素。不過若飯後立即用綠茶漱口，食物中包含鈣質的營養成分就不會浸透到牙齒，反而會因此流失掉。所以作為防蛀牙的對策，進食完後約30分鐘才用綠茶漱口效果最好。