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歷時15個月 雲南怒江草果全基因組精細圖譜繪製成功

博客文章

歷時15個月 雲南怒江草果全基因組精細圖譜繪製成功
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歷時15個月 雲南怒江草果全基因組精細圖譜繪製成功

2021年01月13日 21:54

從20世紀70年代開始,雲南省怒江州就開始種植草果,到2020年,種植面積已達111萬畝,不僅是全國草果的核心產區,也是當地群眾脫貧致富的重要經濟作物。

為了加快提高草果遺傳改良效率,培育高產、抗病、優質、安全新品種,對從源頭創新保障草果產業健康可持續發展,2019年9月,怒江州聯合華南農業大學等國內外高校科研院所機構,正式啟動草果全基因組測序計劃,歷時1年零3個月,成功完成草果全基因組測序工作,繪製了精細圖譜,並於1月13日正式對外發佈。

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通過Nanopore及illumina等測序技術,拼接組裝得到2.08G大小的基因組,組裝出由1145個contig序列組成的草果參考基因組序列,GC含量為40.9%,最長的contig長度為31.6Mb,N50為4.7Mb。結合HiC測序結果,得到24對染色體的高質量基因組,包括42394個基因。通過轉錄組、代謝組關聯分析,得到草果關鍵香氣物質合成的候選基因一批。草果全基因組精細圖譜完成將極大推動草果的全基因組精準育種,為打造國家級草果種質資源圃提供重要基礎作用。




神州快訊

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2021年1月12日08時至13日08時,受強冷空氣影響,海南島有212個鄉鎮最低氣溫小於10℃,116個鄉鎮最低氣溫小於5℃,34個鄉鎮最低氣溫小於3℃,最低值出現在瓊中黎母山林場為-0.3℃。