香港大學李嘉誠醫學院公共衞生學院聯同杜克—新加坡國立大學醫學院及美國聖猶達兒童研究醫院的研究團隊，追溯由1970年代後期開始，從禽類傳播予豬隻的歐洲類禽H1N1（European avian-like H1N1；EA）豬流感病毒，並探討該病毒如何自然跨越禽類及哺乳類動物種屬屏障及其演化過程。
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研究人員重塑代表不同適應階段的EA豬流感始祖病毒並分析其特性，發現病毒裡的聚合酶蛋白和核蛋白分子發生突變，有助促進病毒在豬與豬之間的傳播。研究結果顯示，如果採取流行病學調查和風險評估並用的策略，或可於病毒在哺乳類動物身上完全適應之前，鎖定有機會導致人類大流行的病毒。有關研究文章已於國際著名科學學術期刊《自然微生物》發表。
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由港大醫學院公共衞生學院公共衞生實驗室科學副教授嚴慧玲、聖猶達兒童研究醫院傳染病科博士Richard Webby及杜克—新加坡國立大學醫學院新發傳染病組教授Gavin James Smith帶領的研究團隊，希望透過此研究剖析已在自然中發生的病毒進化過程。研究團隊根據現有的低致病性禽流感病毒和EA豬流感病毒的基因序列，應用始祖基因序列重建技術，重塑自1979年以來，代表不同適應階段的EA豬流感病毒如何從禽類傳播至豬宿主。研究證實，EA豬流感病毒通過逐步改變病毒的受體特性及增強聚合酶活性，以達致在豬隻中高效繁殖及傳播。研究人員亦於1983年後的EA豬流感病毒中，發現聚合酶蛋白PB1-Q621R和核蛋白分子NP-R351K都存在突變，並明顯地提高病毒在豬隻間的傳播能力。
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研究結果顯示，始祖基因序列重建技術適合用於研究新發病原體如何跨物種傳播及其如何適應宿主。人類或許可在禽流感病毒在哺乳類動物宿主內完全適應、繁殖之前進行干預，及早截斷跨物種傳播。干預策略包括：監測有可能在人畜傳染界面間大爆發的病毒，以及在病毒完全適應宿主之前作風險評估。研究團隊相信，在病毒完全適應新宿主之前實施干預策略，不但成功機會較大，亦可善用有限的資源，有效預防疾病大流行。
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