《Nature》重磅研究揭哺乳動物衰老與死亡分子藍圖,有望建立預測壽命及疾病風險新指標。
《Nature》重磅研究揭哺乳動物衰老與死亡分子藍圖,有望建立預測壽命及疾病風險新指標。資料圖片
《Nature》研究揭哺乳動物衰老共同特徵
近日,一項發表於國際頂尖學術期刊《Nature》的研究引起關注。研究團隊整合小鼠、大鼠、食蟹猴及人類4種哺乳動物、超過25種組織、合共逾11000份轉錄組數據,首次系統性揭示推動哺乳動物衰老與死亡的保守轉錄組特徵。
《Nature》重磅研究揭哺乳動物衰老與死亡分子藍圖,有望建立預測壽命及疾病風險新指標。資料圖片
建立衰老及死亡風險時鐘 提供分子監測框架
研究不但建立出高精準度、可跨物種及跨組織應用的「衰老時鐘」與「死亡風險時鐘」,更發現這些分子特徵在慢性疾病、細胞損傷,以至胚胎發育早期等不同情境下,均遵循一套統一的「模組化」架構。相關成果為科學界從分子層面量化、監測,甚至日後乾預特定生理系統的衰老進程,提供了重要框架。
這項研究主要由美國 Mass General Brigham 醫療體系的研究團隊主導,通訊作者為該體系的哈佛醫學院教授、遺傳學家 Vadim N. Gladyshev。
衰老機制仍有謎團 研究尋找共同分子規律
衰老是一個伴隨損傷累積、身體功能下降,以及死亡率呈指數式上升的系統性過程。過往研究已顯示,遺傳、飲食及藥物乾預均可影響壽命,但不同因素背後是否存在共通的分子機制,一直未有清晰答案。
建立大型基因表達數據庫 涵蓋多物種多組織
今次研究正是針對這一核心問題展開,研究團隊希望瞭解,在不同物種、不同組織之間,是否存在一套相對保守的分子規則,能夠統攝正常衰老、早衰模型,以至延壽乾預等不同生物學過程。為此,團隊建立了一個龐大的轉錄組,即基因表達數據庫,涵蓋4539份齧齒類動物樣本,包括小鼠及大鼠,以及6626份靈長類樣本,包括食蟹猴及人類。樣本涉及肝臟、大腦、肌肉、血液等多種組織。
《Nature》重磅研究揭哺乳動物衰老與死亡分子藍圖,有望建立預測壽命及疾病風險新指標。資料圖片
死亡率時鐘可反映壽命干預效果
基於這些數據,研究團隊成功開發出可準確預測個體「分子年齡」的轉錄組時鐘。與只反映時間流逝的「時序年齡時鐘」不同,新建立的「預期死亡率時鐘」能夠整合不同乾預措施對壽命的影響,從而區分短壽模型與長壽干預模型,並具備預測慢性疾病狀態的能力。
發現一:衰老與死亡存在跨物種保守特徵
研究分析顯示,與衰老相關的基因表達變化,在不同物種及細胞類型之間具有高度保守性。研究人員識別出一系列在衰老過程中表達水平一致上升或下降的基因。其中,GPNMB、CDKN1A等基因在衰老過程中表達上調;NREP、COL1A1等基因則呈現下調。值得注意的是,編碼細胞週期抑制蛋白p21的CDKN1A,以及編碼半乳糖凝集素-3的LGALS3,在多個模型中均與死亡率呈現最強的正相關。
功能分析也顯示,炎症反應、干擾素信號及p53通路等會隨衰老而上調;相反,氧化磷酸化、線粒體翻譯及脂肪酸代謝等與能量代謝相關的功能,則會隨衰老而下降。
發現二:衰老並非雜亂無章 而是呈現「模組化」結構
通過基因共表達網絡分析,研究團隊發現,衰老與死亡相關的轉錄組變化並非隨機發生,而是有序地分布於28個功能相對獨立的「模組」之中。每一個模組均代表一個核心細胞子系統,例如炎症及先天免疫、線粒體翻譯及電子傳遞鏈、細胞外基質組織等。研究人員據此進一步建立「模組特異性時鐘」,用以量化特定細胞子系統的衰老速度。
這種模組化視角,讓研究人員不再只是籠統地評估整體衰老,而是能夠更精細地觀察不同生理系統各自的老化程度,為日後針對特定衰老通路進行干預提供新方向。
《Nature》重磅研究揭哺乳動物衰老與死亡分子藍圖,有望建立預測壽命及疾病風險新指標。資料圖片
發現三:體內及體外損傷均會加速分子衰老
研究也證實,這套死亡率特徵具有相當普遍的適用性。無論是在小鼠體內注射脂多糖,引發急性炎症反應,還是在體外培養環境中,令人成纖維細胞經歷複製性衰老、代謝抑制或γ射線照射,這些「損傷」均能迅速在轉錄組時鐘上反映為「分子年齡」加速。
相反,當細胞經過永生化處理,或被重編程為誘導多能幹細胞時,分子年齡則會出現逆轉或下降。這說明該時鐘捕捉的並非單純時間流逝,而是更接近細胞及組織內在的「損傷負擔」。換言之,研究所建立的分子時鐘,或可用作判斷身體及細胞系統受損程度的重要工具。
《Nature》重磅研究揭哺乳動物衰老與死亡分子藍圖,有望建立預測壽命及疾病風險新指標。資料圖片
發現四:與慢性疾病密切相關 具臨床預測潛力
在慢性疾病模型中,研究發現大多數疾病均會加速整體分子年齡,肝細胞癌除外。其中,GPNMB、CDKN1A及LGALS3是最一致地推動死亡風險上升的基因。更重要的是,在人類Framingham心臟研究的血液樣本中,新建立的通用「死亡率時鐘」對死亡時間的預測能力,與第二代DNA甲基化衰老時鐘相若,並優於現有的轉錄組時序年齡時鐘。
此外,在UK Biobank超過5萬人的血漿蛋白質組數據中,GPNMB、CDKN1A及LGALS3的蛋白水平,與全因死亡率,以及心血管疾病、糖尿病、肝硬化、抑鬱症等多種疾病風險呈顯著正相關。這反映相關分子標誌與臨床健康結果之間,存在較緊密的聯繫。
發現五:「年輕血液」與胚胎發育呈現重煥年輕效應
研究也評估了部分已知的「回春」或再年輕化手段,在異種共生實驗中,研究人員將年輕小鼠與年老小鼠的血液循環系統相連,結果發現年老小鼠肝臟的「分子年齡」顯著下降,而且這種效果在解除連接後仍然持續。
從分子特徵來看,這種變化表現為炎症通路下調、代謝通路上調,與正常衰老模式恰好相反。另外,研究人員也首次在轉錄組層面觀察到,小鼠胚胎發育早期存在一個「分子年齡」重置階段。該階段約在胚胎第10天達到最「年輕」狀態,之後分子年齡才再次開始上升。這一發現為理解發育與衰老之間的銜接,提供了新的研究線索。
《Nature》重磅研究揭哺乳動物衰老與死亡分子藍圖,有望建立預測壽命及疾病風險新指標。資料圖片
研究意義:為精準干預衰老提供新框架
整體而言,這項研究建立了一套具解釋力及可推廣性的生物標誌物系統。它不僅能估算整體生物學年齡,更能細分至不同細胞子系統,量化其各自的老化程度。換言之,科學家日後或可像工程師檢查複雜機器的不同部件一樣,逐一評估生命系統中不同模組的衰老狀況,並針對特定通路設計更精準的干預策略。
研究團隊認為,這套跨物種、跨組織的轉錄組藍圖,為理解衰老與死亡的分子基礎提供了重要基石,也為開發與壽命、慢性疾病風險及衰老干預相關的新型生物標誌物,奠定了基礎。